尖锐湿疣的HPV感染通过性接触传播，接触部位的小创伤可促进感染，三种鳞状上皮(皮肤、粘膜、化生的)对HPV感染都敏感。每一型HPV与特殊的临床损害有关，且对皮肤或粘膜鳞状上皮各有其好发部位。当含有比较大量病毒颗粒的脱落表层细胞或角蛋白碎片进入易感上皮裂隙中时，感染就可能产生，它可因直接接触或少见的自动接种或经污染的内裤浴盆、浴巾、便盆感染。
染尖锐湿疣一般不会立即发病，有较长时间的潜伏期，一般为3周至8个月不等，平均为3个月。在感染初期，大多患者没有明显的症状，之后随着病情发展出现外阴瘙痒，有时有灼热感，阴道分泌物明显增多，而且有恶臭味，影响夫妻双方的性欲，使精神上受到不良刺激，也会影响到女性正常排卵。由于该病感染面积大，对局部表皮破坏严重，性交时疼痛明显，甚至引发病变部位出血，致使大部分患者害怕、拒绝性生活。如果病变发生在肛门和直肠，可出现里急后重的感觉。
尖锐湿疣之所以引起不孕，与性交痛或不适而害怕性交而导致性交次数大大减少有关。另外，由于病毒感染的持续存在，阴道受到不断的恶性刺激和严重感染，原本洁净的阴道“内环境”处于恶劣的病毒(有时还会合并细菌感染)污染之中，酸碱度改变，不再是一个适合精子暂时存在的“场所”，其活力大打折扣，使部分精子失去“战斗力”，不能完成精卵结合的“历史使命”。
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